32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3004 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  50.72 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  49.77 
 
 		 215 aa  221  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  39.9 
 
 		 234 aa  154  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  39.39 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  39.3 
 
 		 229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  40.2 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  39.13 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  37.56 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  36.23 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  37.82 
 
 		 222 aa  141  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  37.31 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  32.61 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.72 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  26.89 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  25.7 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  27.86 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  23.66 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  25.81 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  25.96 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  31.45 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  22.81 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  30.41 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  22.96 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  23.64 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  26.15 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  24.88 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  28.76 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  29.79 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.43 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  38 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>