32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3926 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  458  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  38.39 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  41.67 
 
 		 234 aa  177  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  41.67 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  39.82 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  36.77 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  37.05 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  38.46 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  37.82 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  35.19 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  34.7 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  34.55 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  29.06 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.21 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  27.27 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  26.7 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  30.14 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  27.8 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  26.11 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  26.11 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  27.75 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  26 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  25.24 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  27.23 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.15 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  23.72 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  25.11 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  25.89 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  21.74 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  22.22 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  42.55 
 
 		 146 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>