55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0771 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 
222 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  43.58 
 
 
205 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  37.39 
 
 
230 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  40.55 
 
 
224 aa  149  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  30.9 
 
 
239 aa  125  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  32.46 
 
 
225 aa  121  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  32.02 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  32.2 
 
 
225 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  30.48 
 
 
254 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  29.2 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  28.63 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  28.63 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  31.2 
 
 
256 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  29.91 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  27.23 
 
 
219 aa  89  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  29.49 
 
 
234 aa  88.6  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  26.7 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  29.21 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  27.31 
 
 
226 aa  86.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  27.03 
 
 
215 aa  85.1  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  27.35 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  27.31 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  26.11 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  27.72 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  34.15 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  28.36 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  24.89 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  29.5 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.79 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  25 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  23.27 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  25.17 
 
 
159 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  25.79 
 
 
168 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2893  hypothetical protein  24.02 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  26.49 
 
 
194 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  27.34 
 
 
377 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  30.12 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.3 
 
 
393 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  30.87 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  42.55 
 
 
638 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  53.19 
 
 
1051 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  43.48 
 
 
663 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  37.5 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.78 
 
 
627 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  43.4 
 
 
1082 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.81 
 
 
954 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  39.13 
 
 
657 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  37.5 
 
 
167 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  30.51 
 
 
338 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3821  hypothetical protein  40.35 
 
 
96 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 
163 aa  42  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  44.23 
 
 
364 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  43.48 
 
 
190 aa  42  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 
340 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>