99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00390 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  734    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  83.52 
 
 		 364 aa  632  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  54.47 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  53.27 
 
 		 353 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  33.82 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  35.53 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  34.62 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  34.65 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  32.77 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  32.7 
 
 		 374 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 		 376 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 		 376 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  32.43 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  32.79 
 
 		 376 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  31.32 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  32.54 
 
 		 361 aa  172  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  32.71 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  31.36 
 
 		 345 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  32.15 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  33.23 
 
 		 368 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  32.94 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  31.42 
 
 		 338 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  30.42 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  30.24 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  29.82 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.61 
 
 		 389 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  30.64 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  30.52 
 
 		 345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  30.77 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  30 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  31.25 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  28.22 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  29.56 
 
 		 403 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  27.91 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  27.11 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  31.44 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  28.66 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  27.35 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  27.89 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  28.19 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  27.07 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  28.79 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  28.79 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  29.03 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  28.33 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  29.09 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  27.86 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  28.33 
 
 		 345 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  27.89 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  28.02 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  26.65 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  26.61 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  27.65 
 
 		 408 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  28.65 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  27.67 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  26.32 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  25.61 
 
 		 377 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  26.76 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  26.54 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  27.67 
 
 		 387 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.38 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  26.59 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.04 
 
 		 429 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  26.99 
 
 		 417 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  26.4 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  25.84 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  26.16 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  26.61 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  24.52 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  33.87 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  24.38 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  25.39 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  25.91 
 
 		 333 aa  87  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  25.07 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  23.5 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  27.84 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  24.85 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  24.76 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  24.68 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  24.4 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  37.1 
 
 		 166 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  43.48 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  34.72 
 
 		 566 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  34.18 
 
 		 163 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  37.31 
 
 		 651 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  38.6 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  41.82 
 
 		 935 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3277  lysM domain-containing protein  36.14 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2281  LysM domain-containing protein  45.24 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0169093  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 1051 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  35.48 
 
 		 167 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  45.1 
 
 		 243 aa  43.1  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  34.21 
 
 		 219 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  29.36 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  29.36 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>