15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1744 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  354  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  35.12 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  28.47 
 
 
254 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  24.82 
 
 
285 aa  61.6  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  26 
 
 
219 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  25.53 
 
 
256 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  24.43 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  25.53 
 
 
205 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.12 
 
 
222 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  27.66 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  25.32 
 
 
251 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  26.5 
 
 
219 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  21.47 
 
 
225 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  23.87 
 
 
225 aa  44.3  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  21.3 
 
 
168 aa  40.8  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>