41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1955 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  40.67 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  37.09 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  37.38 
 
 		 224 aa  135  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.9 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  31.65 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  30.99 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  29.91 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  28.5 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  28.7 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  28.24 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  29.95 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  26.22 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  26.42 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  26.58 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  26.41 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  26.58 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  26.42 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  25.44 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  22.37 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.5 
 
 		 285 aa  62  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  25.79 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  28.26 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  26.04 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.08 
 
 		 954 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  30.41 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  25.26 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  21.79 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  45.83 
 
 		 663 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  28.66 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  25.34 
 
 		 159 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  42.55 
 
 		 657 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  34.57 
 
 		 543 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0072  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.24 
 
 		 334 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.859252  normal  0.733338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  40.43 
 
 		 659 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3820  hypothetical protein  29.49 
 
 		 156 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1884  hypothetical protein  29.49 
 
 		 156 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.27287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0936  hypothetical protein  29.49 
 
 		 156 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00416264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>