20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1079 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  742    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  32.37 
 
 
226 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  28.29 
 
 
220 aa  90.5  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  30.07 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  31.4 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  28.67 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  30.56 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  30.07 
 
 
235 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  31.25 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  27.22 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  28.12 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  29.08 
 
 
221 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  25.81 
 
 
213 aa  60.1  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.11 
 
 
222 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  29.23 
 
 
236 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  26.53 
 
 
204 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  28.12 
 
 
159 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  26.81 
 
 
225 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  27.14 
 
 
225 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  29.6 
 
 
219 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>