105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4808 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  28.84 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1417  Peptidoglycan-binding LysM  24.76 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  24.04 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  25.82 
 
 		 285 aa  61.6  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4246  Peptidoglycan-binding LysM  24.62 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0620  Phage related protein  27.13 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0683  Phage related protein  27.13 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  48.39 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  50.98 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  50.98 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  50.98 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  50.98 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  50.98 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.28 
 
 		 954 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  50.98 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  50.98 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  50.98 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  50.98 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  50.98 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  50.98 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  50.98 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  50.98 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  55.1 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  55.1 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  42.03 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1442  hypothetical protein  23.5 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 546 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  49.02 
 
 		 168 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  50 
 
 		 456 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  46.15 
 
 		 158 aa  52  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  51.92 
 
 		 158 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.33 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  51.02 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  51.02 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 163 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  51.02 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  48.98 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  48.08 
 
 		 156 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  48.98 
 
 		 166 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  51.02 
 
 		 146 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  51.02 
 
 		 162 aa  49.3  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  46.94 
 
 		 145 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1904  LysM domain/BON superfamily protein  48.08 
 
 		 156 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  51.02 
 
 		 162 aa  49.3  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  38.1 
 
 		 6272 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  38.33 
 
 		 384 aa  48.9  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1818  LysM domain/BON superfamily protein  46.15 
 
 		 156 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 		 97 aa  48.5  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  45.1 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6198  LysM domain/BON superfamily protein  46.15 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0206564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1881  LysM domain/BON superfamily protein  46.15 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168616  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  43.4 
 
 		 161 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  48.98 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1393  LysM domain/BON superfamily protein  48.98 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  40 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  35.38 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1790  LysM domain/BON superfamily protein  46.15 
 
 		 156 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  43.14 
 
 		 168 aa  47  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  42.55 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  39.62 
 
 		 436 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 384 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 		 154 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  48.94 
 
 		 146 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  48.94 
 
 		 146 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  37.7 
 
 		 340 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  41.07 
 
 		 440 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  41.07 
 
 		 440 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 5236 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  46.94 
 
 		 185 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  46.94 
 
 		 150 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 5189 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  30.56 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.98 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  41.51 
 
 		 394 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  46.94 
 
 		 334 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  45.76 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  36.51 
 
 		 440 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2328  peptidoglycan-binding LysM  34.29 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000346433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2193  peptidoglycan-binding LysM  24.5 
 
 		 521 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 651 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 334 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 334 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  46.94 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 377 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  36.84 
 
 		 335 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  44.9 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  45.65 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  32.26 
 
 		 335 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  41.51 
 
 		 663 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  42.31 
 
 		 353 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  39.62 
 
 		 638 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 388 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>