51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2242 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2242  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 334 aa  678    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1003  FMN-binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 576 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000126222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  52.94 
 
 		 203 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  51.85 
 
 		 205 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2012  peptidoglycan-binding LysM  39 
 
 		 201 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.340695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.81 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 		 709 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  52.08 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  32.61 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  39.51 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  50 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0704  peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1070  endolysin, putative  50 
 
 		 491 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.898366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  44.26 
 
 		 1556 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 207 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  40.62 
 
 		 568 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4559  spovid-dependent spore coat assembly factor safa; ftsk/spoiiie family protein; surface protein pspc  45.65 
 
 		 613 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  40.68 
 
 		 604 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  33.73 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  23.46 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  51.11 
 
 		 739 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0690  SpoVID-dependent spore coat assembly factor SafA  38.98 
 
 		 631 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.538953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4507  spore coat assembly protein SafA  43.48 
 
 		 615 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219196 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  33.64 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  40 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  31.58 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  40 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4512  lysM domain-containing protein  48.78 
 
 		 608 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4324  lysM domain-containing protein  43.48 
 
 		 587 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  43.48 
 
 		 621 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  43.48 
 
 		 609 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0920  spore coat assembly protein SafA  40.91 
 
 		 538 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  26.09 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  43.4 
 
 		 520 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  40.91 
 
 		 432 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  42.31 
 
 		 523 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.33 
 
 		 470 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4659  lysm domain-containing protein  46.34 
 
 		 582 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00627115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1073  Peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 221 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  41.51 
 
 		 520 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  27.19 
 
 		 727 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  31.4 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  31.4 
 
 		 334 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4273  spore coat assembly protein SafA  35.59 
 
 		 721 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  27.19 
 
 		 727 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 1225 aa  42.7  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1314  peptidoglycan-binding LysM  52.08 
 
 		 253 aa  42.4  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  41.3 
 
 		 674 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>