62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0920 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0920  spore coat assembly protein SafA  100 
 
 
538 aa  1016    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  61.73 
 
 
432 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  40.99 
 
 
621 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4507  spore coat assembly protein SafA  67.61 
 
 
615 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219196 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4324  lysM domain-containing protein  67.61 
 
 
587 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  42.31 
 
 
609 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4273  spore coat assembly protein SafA  44.7 
 
 
721 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4559  spovid-dependent spore coat assembly factor safa; ftsk/spoiiie family protein; surface protein pspc  67.61 
 
 
613 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  66.2 
 
 
604 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0690  SpoVID-dependent spore coat assembly factor SafA  41.03 
 
 
631 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.538953  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  67.61 
 
 
674 aa  96.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4659  lysm domain-containing protein  63.64 
 
 
582 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00627115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4512  lysM domain-containing protein  41.18 
 
 
608 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf584  virulence-associated lipoprotein MIA  42.04 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0652484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0704  peptidoglycan-binding LysM  38.57 
 
 
411 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.77 
 
 
377 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.35 
 
 
327 aa  53.5  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  40.43 
 
 
465 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  46 
 
 
194 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  50 
 
 
509 aa  52  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
498 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.38 
 
 
470 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4490  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 
744 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474839  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  44.68 
 
 
335 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
423 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 
590 aa  50.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  45.65 
 
 
523 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  46.81 
 
 
301 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  31.71 
 
 
304 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  38.3 
 
 
320 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  50 
 
 
338 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 
207 aa  47.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0893  Peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 
137 aa  47.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 
522 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  37.88 
 
 
301 aa  47.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  32.81 
 
 
217 aa  47.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  42.55 
 
 
297 aa  47.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  39.22 
 
 
292 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  39.22 
 
 
291 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  45.45 
 
 
204 aa  47  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  46.81 
 
 
203 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0546  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.81 
 
 
415 aa  47  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  39.22 
 
 
294 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  37.7 
 
 
751 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 
192 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  40.35 
 
 
302 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  42.31 
 
 
520 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  44.44 
 
 
265 aa  45.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  43.64 
 
 
142 aa  45.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 
307 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  47.92 
 
 
231 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.41 
 
 
389 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  41.67 
 
 
284 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  46.67 
 
 
267 aa  44.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 
219 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  45.45 
 
 
274 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  46.67 
 
 
255 aa  43.9  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.07 
 
 
554 aa  43.9  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0050  Peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 
507 aa  43.9  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 
334 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  41.94 
 
 
409 aa  43.5  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 
334 aa  43.5  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>