129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2012 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2012  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.340695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  59.52 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  55.81 
 
 		 253 aa  52.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  36.56 
 
 		 447 aa  52  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  39.73 
 
 		 498 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00645  hemagglutinin  56.82 
 
 		 283 aa  51.6  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0182  Peptidoglycan-binding LysM  43.18 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.71 
 
 		 354 aa  51.2  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  42.59 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  37.18 
 
 		 399 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  37.68 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1913  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  51.79 
 
 		 298 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0071  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  31.62 
 
 		 303 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.616993  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0423  putative lipoprotein NlpD  40 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.897746  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0825  peptidase  40 
 
 		 343 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  48.98 
 
 		 444 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1801  putative lipoprotein NlpD  40 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2512  putative peptidase  40 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2373  putative peptidase  40 
 
 		 343 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0472  putative lipoprotein NlpD  40 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  52.38 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  48.08 
 
 		 849 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  42.59 
 
 		 518 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 733 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  51.02 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  52.27 
 
 		 367 aa  48.9  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  40.35 
 
 		 409 aa  48.5  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  47.62 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  36.84 
 
 		 239 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  44.07 
 
 		 544 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  44.9 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  53.49 
 
 		 341 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  45.1 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  39.71 
 
 		 619 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  45.45 
 
 		 509 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  41.82 
 
 		 440 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  50 
 
 		 303 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  39.29 
 
 		 647 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  48.84 
 
 		 423 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  37.33 
 
 		 610 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 466 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  38.36 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  44.19 
 
 		 523 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  36.49 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  34.94 
 
 		 414 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 419 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  46.51 
 
 		 620 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  50 
 
 		 290 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  30.17 
 
 		 301 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 503 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  36.84 
 
 		 323 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0755  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.32 
 
 		 448 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  47.62 
 
 		 324 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 327 aa  45.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2242  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 334 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  43.64 
 
 		 263 aa  45.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 561 aa  45.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  36.67 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 289 aa  45.1  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  39.06 
 
 		 539 aa  44.7  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1604  M24/M37 family peptidase  43.4 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1389  M24/M37 family peptidase  48.84 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000798303  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.71 
 
 		 1001 aa  44.3  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  48.84 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000118576  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  33.6 
 
 		 590 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  35.71 
 
 		 412 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  37.84 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.86 
 
 		 377 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  38.64 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  37.84 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  36.9 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1534  peptidase, M23/M37 family  48.84 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3811  peptidase, M23/M37 family  48.84 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000746797  unclonable  9.38185e-26 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  41.86 
 
 		 430 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 511 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1362  cell wall endopeptidase  48.84 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.83171e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1361  cell wall endopeptidase  48.84 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000286273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  37.84 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  37.84 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  39.62 
 
 		 334 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  39.62 
 
 		 334 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  42.42 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1402  peptidase M23B  46.51 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  37.84 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  32.04 
 
 		 571 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  51.16 
 
 		 298 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1640  peptidase, M23/M37 family  48.84 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000676143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1572  peptidase, M23/M37 family  48.84 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.42945e-48 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  47.62 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  30.53 
 
 		 563 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  36.23 
 
 		 342 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  43.48 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  44.44 
 
 		 361 aa  42.7  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  41.86 
 
 		 446 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  42.55 
 
 		 274 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  36.92 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0140  hypothetical protein  29.82 
 
 		 243 aa  42.4  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>