160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0140 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0140  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  32.77 
 
 		 602 aa  73.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  35.04 
 
 		 495 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.84 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  34.86 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  32.28 
 
 		 620 aa  66.2  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 587 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  32.74 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  34.51 
 
 		 527 aa  65.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.13 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  32.12 
 
 		 544 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  31.67 
 
 		 595 aa  62.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  38.46 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  34.29 
 
 		 409 aa  62.4  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  41.76 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  33.64 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  35.78 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  34.58 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  35.34 
 
 		 547 aa  58.9  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  34.48 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.54 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.91 
 
 		 517 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  32.04 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  33.68 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  35.19 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  29.38 
 
 		 610 aa  55.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  30.99 
 
 		 495 aa  55.5  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  29.69 
 
 		 580 aa  55.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  34.43 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  27.59 
 
 		 442 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.84 
 
 		 568 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  24.07 
 
 		 544 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.76 
 
 		 554 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  24.57 
 
 		 464 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.62 
 
 		 532 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  29.27 
 
 		 324 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  30.77 
 
 		 515 aa  52.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  51.79 
 
 		 503 aa  52.4  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  29.31 
 
 		 250 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  30.56 
 
 		 524 aa  52  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  24.83 
 
 		 556 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  31.78 
 
 		 444 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  27.69 
 
 		 539 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  33 
 
 		 511 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  34.23 
 
 		 298 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  33.64 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  29.06 
 
 		 515 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  31.75 
 
 		 430 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  28.85 
 
 		 1556 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  27.74 
 
 		 517 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 733 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  32.2 
 
 		 479 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  53.66 
 
 		 367 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  31.48 
 
 		 523 aa  49.7  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  28.44 
 
 		 548 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 338 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.06 
 
 		 527 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  29.06 
 
 		 515 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.35 
 
 		 528 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25 
 
 		 406 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25 
 
 		 406 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25 
 
 		 406 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1186  Slt family transglycosylase  38.81 
 
 		 398 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  31.71 
 
 		 323 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  29.06 
 
 		 515 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25 
 
 		 406 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  32.38 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  28.97 
 
 		 445 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  28.95 
 
 		 334 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  28.95 
 
 		 334 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  29.34 
 
 		 483 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  30.25 
 
 		 509 aa  48.5  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  28.29 
 
 		 523 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  30.51 
 
 		 445 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  30.83 
 
 		 474 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  34.91 
 
 		 519 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  34.91 
 
 		 515 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  34.91 
 
 		 515 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  34.91 
 
 		 515 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  29.25 
 
 		 596 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  29.03 
 
 		 1021 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  29.94 
 
 		 474 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  31.46 
 
 		 173 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2772  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.12 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00294465  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  32.91 
 
 		 534 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  24.44 
 
 		 455 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.01 
 
 		 465 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  46.51 
 
 		 479 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.23 
 
 		 1001 aa  47  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.56 
 
 		 617 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  27.93 
 
 		 341 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  28.33 
 
 		 440 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 517 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  28.43 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.91 
 
 		 530 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  30.91 
 
 		 534 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  29.34 
 
 		 483 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  29.34 
 
 		 483 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  43.14 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>