60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2402 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2402  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 511 aa  1011    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  31.5 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2402  peptidoglycan-binding LysM  27.9 
 
 		 522 aa  229  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3794  peptidoglycan-binding LysM  23.35 
 
 		 523 aa  143  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  25.05 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  25.66 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0598  peptidoglycan-binding LysM  23.5 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0193  Peptidoglycan-binding LysM  21.66 
 
 		 536 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21410  Peptidoglycan-binding LysM  23.97 
 
 		 530 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  21.93 
 
 		 509 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0053  peptidoglycan-binding LysM  19.73 
 
 		 545 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.60632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  21.43 
 
 		 567 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  57.5 
 
 		 338 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22240  Peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 		 619 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  21.46 
 
 		 500 aa  53.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  51.16 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  47.62 
 
 		 208 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21380  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.83 
 
 		 181 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  48.94 
 
 		 341 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  41.51 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 		 539 aa  48.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  47.37 
 
 		 265 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  47.37 
 
 		 265 aa  47.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  47.5 
 
 		 267 aa  47.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00645  hemagglutinin  50 
 
 		 283 aa  47  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  37.93 
 
 		 372 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.92 
 
 		 612 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 		 612 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  32.86 
 
 		 596 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  37.93 
 
 		 372 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  52.5 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  52.5 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1203  peptidase M23B  46 
 
 		 204 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  31.07 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  48.78 
 
 		 324 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  38.6 
 
 		 498 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  41.86 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  30.26 
 
 		 661 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.84 
 
 		 327 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 523 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  53.06 
 
 		 184 aa  44.7  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  29.17 
 
 		 580 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0052  hypothetical protein  23.33 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0618003  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  45.24 
 
 		 289 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  45.45 
 
 		 582 aa  44.3  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  41.86 
 
 		 503 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.1 
 
 		 354 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  50 
 
 		 271 aa  44.3  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  50 
 
 		 271 aa  44.3  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1402  peptidase M23B  38.18 
 
 		 204 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.21 
 
 		 372 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2012  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 201 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.340695  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  44.19 
 
 		 546 aa  43.9  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  44 
 
 		 205 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2576  stage VI sporulation protein D  45.45 
 
 		 431 aa  43.9  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 546 aa  43.9  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  50.98 
 
 		 1556 aa  43.9  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 446 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  38 
 
 		 298 aa  43.1  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 620 aa  43.5  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>