130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5743 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 571 aa  1192    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  38.58 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  37.8 
 
 		 150 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  33.33 
 
 		 220 aa  72.4  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  35.16 
 
 		 153 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  31.61 
 
 		 143 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  32.56 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  37.31 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  37.31 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  34.62 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  33.54 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  33.54 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  35.11 
 
 		 164 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  29.8 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  29.8 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  33.54 
 
 		 149 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  32.45 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  35.88 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  30.13 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  33.98 
 
 		 178 aa  59.7  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  33.33 
 
 		 164 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  30.3 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  31.13 
 
 		 187 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  35.11 
 
 		 166 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  31.79 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  29.8 
 
 		 187 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  28.17 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  31.4 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  30 
 
 		 538 aa  57  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  31.78 
 
 		 205 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  33.59 
 
 		 166 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  33.59 
 
 		 166 aa  56.6  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4051  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.51 
 
 		 267 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  37.86 
 
 		 186 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  49.12 
 
 		 216 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  33.06 
 
 		 182 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  25.56 
 
 		 427 aa  54.3  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  27.52 
 
 		 534 aa  53.9  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  25.56 
 
 		 427 aa  53.9  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  61.36 
 
 		 164 aa  54.3  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 186 aa  53.9  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  45.76 
 
 		 165 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  27.78 
 
 		 209 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  33.33 
 
 		 165 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  29.68 
 
 		 145 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 		 260 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  25.93 
 
 		 509 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.08 
 
 		 840 aa  51.2  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3711  hypothetical protein  34.09 
 
 		 216 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  37 
 
 		 554 aa  51.2  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.29 
 
 		 554 aa  50.8  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  40.32 
 
 		 222 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  24.51 
 
 		 283 aa  50.4  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.95 
 
 		 797 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  28.8 
 
 		 318 aa  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  32.12 
 
 		 279 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  38.24 
 
 		 479 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  50 
 
 		 175 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  37.5 
 
 		 330 aa  48.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  29.29 
 
 		 323 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  26.55 
 
 		 546 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2877  putative metalloendopeptidase  28.46 
 
 		 196 aa  47.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0252597  normal  0.352691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  48.84 
 
 		 580 aa  47.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  37.97 
 
 		 438 aa  47.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 289 aa  47.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  31.5 
 
 		 298 aa  47.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  35.06 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0866  Peptidase M23  30.48 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.329722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  35.06 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  30.99 
 
 		 158 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  30.85 
 
 		 417 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 		 542 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2300  hypothetical protein  28.78 
 
 		 293 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  36.84 
 
 		 153 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  36.84 
 
 		 153 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  28.7 
 
 		 595 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  53.49 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  41.38 
 
 		 184 aa  45.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  44.23 
 
 		 261 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.49 
 
 		 270 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  36.07 
 
 		 557 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  44.23 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2772  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.53 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00294465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  30.68 
 
 		 352 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  46.51 
 
 		 548 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  44.19 
 
 		 517 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  39.06 
 
 		 424 aa  45.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 		 579 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 338 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  34.33 
 
 		 515 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.38 
 
 		 499 aa  45.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3794  peptidoglycan-binding LysM  34.94 
 
 		 523 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  35.38 
 
 		 487 aa  45.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  46.51 
 
 		 552 aa  44.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  45.59 
 
 		 495 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  34.33 
 
 		 515 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3283  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.86 
 
 		 476 aa  44.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000101703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  32 
 
 		 290 aa  44.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>