53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3711 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3711  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  60.1 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  41.1 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  34.12 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  36.42 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  40.41 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  35.03 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  35.9 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  35.9 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  35.9 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  33.55 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  31.61 
 
 		 142 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  34.01 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  34.59 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  31.79 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  33.11 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  33.33 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  32.89 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  34.35 
 
 		 571 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  32.21 
 
 		 150 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0283  hypothetical protein  34.36 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  41.76 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  41.76 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  33.75 
 
 		 166 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  33.11 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  35.17 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  35.17 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  34.87 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  35.71 
 
 		 391 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  33.75 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  33.75 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  33.12 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  33.99 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  34.42 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  34 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  35.25 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  32.35 
 
 		 158 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  29.75 
 
 		 583 aa  50.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  26.62 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  27.1 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  27.92 
 
 		 169 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4051  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.59 
 
 		 267 aa  45.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 		 417 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  27.83 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  33.58 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  33.58 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1421  hypothetical protein  33.05 
 
 		 161 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 165 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>