55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0625 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3711  hypothetical protein  61.83 
 
 		 216 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  39.33 
 
 		 187 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  39.33 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  40 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  30.84 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  32.45 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  33.33 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  32.91 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  36.42 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  36.49 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  35.76 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  36.49 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0283  hypothetical protein  34 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  30.38 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  34.67 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  27.15 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  33.33 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  35.33 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  35.33 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  32.69 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  32.69 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  35.29 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  34 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  30.46 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  34.23 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  33.56 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  34.21 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  33.54 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  29.05 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  29.63 
 
 		 583 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  33.55 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  33.55 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  34.67 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  30.13 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  34.17 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  27.78 
 
 		 571 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  26.28 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4051  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.22 
 
 		 267 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  30 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  26.53 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5055  hypothetical protein  33.64 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0581426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  32.54 
 
 		 175 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  26.99 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1421  hypothetical protein  30.28 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  23.65 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  30.6 
 
 		 417 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  28.78 
 
 		 158 aa  42.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  25.85 
 
 		 170 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 		 171 aa  41.6  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  25.85 
 
 		 170 aa  41.2  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>