104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1416 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 187 aa  364  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  95.72 
 
 		 187 aa  347  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  86.77 
 
 		 209 aa  298  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  59.49 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  43.9 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  40.6 
 
 		 220 aa  107  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  38.19 
 
 		 143 aa  94.4  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  34.72 
 
 		 142 aa  90.9  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  37.86 
 
 		 145 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  38.19 
 
 		 143 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  39.33 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  36.96 
 
 		 150 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  37.19 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  36.23 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  32.96 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 417 aa  82  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  45.38 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  46.61 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  38.24 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  46.61 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  37.5 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  41.91 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  42.86 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  44.07 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3711  hypothetical protein  41.1 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  44.07 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  44.07 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  34.92 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  35.34 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  35.34 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  35.34 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  32.31 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  35.71 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  36.07 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  29.73 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  36.11 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  38.05 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  38.05 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  34.26 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  37.17 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  37.17 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0196212 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  38.05 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  38.05 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  33.94 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  37.17 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  34.26 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  33.33 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  34.26 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  37.17 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  40.2 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  34.45 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  37.17 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  37.17 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  37.17 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  33.93 
 
 		 583 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  36.28 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  40.35 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  39.47 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  39.47 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  32.41 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  34.43 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  34.51 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  35.4 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  34.19 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  39.81 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  39.81 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  35.4 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  38.14 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  32.41 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0283  hypothetical protein  32.81 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  31.13 
 
 		 571 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  39.13 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  35.4 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  37.5 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  32.28 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  31.48 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  30.51 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  31.48 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1740  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 638 aa  51.6  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.696561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  33.64 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  31.34 
 
 		 391 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  32.11 
 
 		 136 aa  48.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  32.73 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4051  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.05 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  31.82 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  27.35 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4178  phage related lysozyme  33.77 
 
 		 96 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.579424  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1312  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.45 
 
 		 307 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 		 260 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>