141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3388 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  100 
 
 		 143 aa  290  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  57.43 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  57.43 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  56.08 
 
 		 149 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  52.48 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  50.35 
 
 		 142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  50.7 
 
 		 205 aa  136  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  48.18 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  51.08 
 
 		 153 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  53.57 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  53.19 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  52.48 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  46.85 
 
 		 220 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  52.14 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  45.58 
 
 		 220 aa  130  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  46.71 
 
 		 225 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  46.71 
 
 		 225 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  50 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  47.52 
 
 		 164 aa  123  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  48.55 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  47.52 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  48.55 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  48.55 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  47.86 
 
 		 165 aa  120  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  43.36 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  42.14 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  44.76 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  44.76 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  44.76 
 
 		 170 aa  111  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  43.24 
 
 		 166 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  45.83 
 
 		 341 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  46.46 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  42.76 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  49.14 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  45.67 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  45.67 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  40.28 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  39.55 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  41.26 
 
 		 417 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  40.76 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  38.73 
 
 		 211 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  39.31 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  39.44 
 
 		 182 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  37.5 
 
 		 165 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  37.5 
 
 		 165 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  37.5 
 
 		 165 aa  90.1  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  39.38 
 
 		 391 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  37.5 
 
 		 187 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  36.72 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  38.19 
 
 		 187 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  36.72 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  37.12 
 
 		 163 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  37.06 
 
 		 169 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  35.94 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  35.94 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  34.59 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  37.21 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4178  phage related lysozyme  47.25 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.579424  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  34.96 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  35.07 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  36 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  37.16 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  35.95 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  33.79 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1740  glycoside hydrolase family protein  35.92 
 
 		 638 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.696561 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  38.62 
 
 		 583 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  35.53 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  36.11 
 
 		 209 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 		 186 aa  77  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  36.24 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  34.53 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  37.58 
 
 		 243 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  35.66 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  38.6 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  38.6 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  35.81 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  32.45 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  38.6 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2335  Phage-related lysozyme  36.92 
 
 		 270 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  37.72 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  37.72 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  36.84 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  37.72 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  36.84 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3711  hypothetical protein  36.42 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  37.72 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  36.84 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  37.72 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>