99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0871 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 170 aa  351  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  66.47 
 
 		 169 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  63.1 
 
 		 170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  59.39 
 
 		 169 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  59.39 
 
 		 170 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  59.39 
 
 		 170 aa  209  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  58.79 
 
 		 171 aa  207  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  60.36 
 
 		 169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  36.61 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  39.86 
 
 		 170 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  42.14 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  36.11 
 
 		 220 aa  94.4  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  37.59 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  36.5 
 
 		 143 aa  93.2  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  35.42 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  36.3 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  34.85 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  37.23 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3826  glycoside hydrolase family 24  31.84 
 
 		 181 aa  87.4  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  35.81 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  34.72 
 
 		 220 aa  85.5  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  35.82 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  35.14 
 
 		 149 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  35.14 
 
 		 149 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  33.33 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  35.14 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1046  lysozyme  28.49 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  36.36 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  36.36 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  36.36 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  33.33 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  34.46 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  36.96 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  35.61 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  35.61 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  35.61 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  35.38 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  36.73 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  36.69 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  36.69 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  35.86 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  34.07 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  34.69 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  34.69 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  30.15 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  35.51 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  35.17 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  35.29 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  35.29 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  34.78 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  35.51 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  35.38 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  35.38 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  31.65 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  32.91 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  33.79 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  33.83 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  33.1 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  33.1 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  32.35 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  31.47 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  31.72 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  33.1 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  29.3 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  32.41 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  31.76 
 
 		 583 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  34.78 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  32.43 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3556  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  42.25 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.647883  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  36.14 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00835  conserved hypothetical protein  51.11 
 
 		 48 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  29.19 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  28.41 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  30.61 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  30.86 
 
 		 260 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  28 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1740  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 		 638 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.696561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4670  glycoside hydrolase family protein  40.32 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  0.812257 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3711  hypothetical protein  26.45 
 
 		 216 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  30.34 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  23.65 
 
 		 209 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0567  lysozyme  38.89 
 
 		 92 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00527525  hitchhiker  0.00000000000000685681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  26.55 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2036  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  37.88 
 
 		 95 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00134348  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  24.34 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>