129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0580 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  100 
 
 		 153 aa  312  8e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  53.06 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  53.06 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  54.55 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  53.85 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  51.08 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  51.35 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  51.35 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  51.35 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  41.67 
 
 		 220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  46.9 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  46.9 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  44.6 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  46.36 
 
 		 225 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  46.36 
 
 		 225 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  46.9 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  46.9 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  46.9 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  43.26 
 
 		 186 aa  111  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  47.66 
 
 		 178 aa  110  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  40.14 
 
 		 220 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  45.52 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  45.52 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  45.45 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  43.71 
 
 		 205 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  43.62 
 
 		 583 aa  106  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  42.75 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  45.89 
 
 		 341 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  40.15 
 
 		 165 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  38.19 
 
 		 417 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  39.39 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  39.07 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  38.64 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  39.49 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  38.64 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  38.64 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  38.64 
 
 		 165 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  38.64 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  39.49 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  37.88 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  39.19 
 
 		 182 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  35.88 
 
 		 260 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  35.77 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  36.91 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  35.67 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  36.48 
 
 		 391 aa  87.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  36.88 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  42.19 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  42.19 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  43.36 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  38.46 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  33.79 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  35.33 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  39.16 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  31.69 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  30.34 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  30.41 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  33.09 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  33.09 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4051  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.52 
 
 		 267 aa  70.9  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  35.16 
 
 		 571 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  31.94 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  32.37 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  32.37 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  31.61 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  33.09 
 
 		 169 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  37.01 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2335  Phage-related lysozyme  34.81 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0567  lysozyme  48.53 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00527525  hitchhiker  0.00000000000000685681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3812  putative phage endolysin  32.74 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3799  putative phage endolysin  32.74 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3980  putative phage endolysin  32.74 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.526858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3877  putative phage endolysin  32.74 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3920  putative phage endolysin  32.74 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1740  glycoside hydrolase family protein  32.39 
 
 		 638 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.696561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  31.69 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  31.91 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  29.8 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  28.93 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  28.93 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  29.05 
 
 		 209 aa  57  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  28.3 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  28.83 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  28.83 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  30.13 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  28.93 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  28.93 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  28.3 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  28.3 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  26.43 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  28.22 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>