130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2648 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  100 
 
 		 158 aa  326  8e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  47.3 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  44.1 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  44.1 
 
 		 167 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  51.56 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  51.56 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  56.35 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  56.35 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  51.56 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  51.56 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  51.56 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  51.56 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  44.16 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  47.45 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  42.04 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  48.03 
 
 		 220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  45.45 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  46.46 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  46.09 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  45.97 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  44.88 
 
 		 220 aa  101  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  44.7 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  44.7 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  41.56 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  48.74 
 
 		 225 aa  97.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  48.74 
 
 		 225 aa  97.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  47.06 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  47.06 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  42.42 
 
 		 136 aa  97.8  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  43.65 
 
 		 178 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  44.7 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  44.7 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  42.64 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  42.64 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 196 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  43.94 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  43.94 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  43.94 
 
 		 165 aa  93.6  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  45.59 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  42.42 
 
 		 205 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  41.54 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  41.54 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  41.77 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  44.14 
 
 		 175 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  37.11 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 		 186 aa  85.5  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  40 
 
 		 177 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  40 
 
 		 177 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  40 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  40.14 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  36.67 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  37.33 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  36.67 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  34.97 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  37.33 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  38.06 
 
 		 341 aa  81.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  36 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  37.4 
 
 		 417 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  36 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  36 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  39.06 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  39.84 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  39.84 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  37.8 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  36.88 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  36 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  38.19 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  41.43 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  38.1 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  36 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  37.16 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  36 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  40.71 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  34.85 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  38.52 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  36.05 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  37.7 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  33.33 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  35.71 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  36.13 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  36.36 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  36.13 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  40.3 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  36.42 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  36.42 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2335  Phage-related lysozyme  38.46 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  39.53 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  37.01 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  38.93 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  31.76 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  31.9 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  38.28 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  32.75 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>