136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4784 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  100 
 
 
148 aa  294  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  99.32 
 
 
148 aa  293  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  69.18 
 
 
150 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  68.49 
 
 
150 aa  196  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  53.06 
 
 
153 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  50 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  53.19 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  54.73 
 
 
149 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  53.19 
 
 
143 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  54.73 
 
 
149 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  53.38 
 
 
149 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  49.67 
 
 
225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  49.67 
 
 
225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  50.7 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  49.66 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  48.3 
 
 
166 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  48.3 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  48.3 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  48.98 
 
 
164 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  48.59 
 
 
165 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  43.36 
 
 
220 aa  108  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  38.89 
 
 
220 aa  106  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  46.48 
 
 
341 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  41.1 
 
 
186 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  43.87 
 
 
391 aa  100  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  42.38 
 
 
205 aa  99  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  41.38 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  46.55 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  43.28 
 
 
157 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  46.4 
 
 
178 aa  93.6  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  46.88 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  46.88 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  37.23 
 
 
159 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  39.39 
 
 
167 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  39.39 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  39.39 
 
 
165 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  41.54 
 
 
158 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  38.31 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  38.03 
 
 
583 aa  89.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  40.82 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  38.64 
 
 
165 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  38.64 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  38.64 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  38.64 
 
 
165 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  38.76 
 
 
165 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  40.69 
 
 
152 aa  84  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  43.24 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  42.57 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  39.46 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  35.66 
 
 
169 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  36.43 
 
 
417 aa  79.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.530155 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  35 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  38.24 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  40.82 
 
 
156 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  38.93 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4051  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.26 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  36.76 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  36.59 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  37.78 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  36.76 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  34.69 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  34.78 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  35.66 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  34.44 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  35.21 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2335  Phage-related lysozyme  40.46 
 
 
270 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  35.76 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  34.93 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  33.1 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4178  phage related lysozyme  42.68 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.579424  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3812  putative phage endolysin  36.27 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3980  putative phage endolysin  36.27 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.526858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3799  putative phage endolysin  36.27 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3877  putative phage endolysin  36.27 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3920  putative phage endolysin  36.27 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  37.5 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  34.51 
 
 
170 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0567  lysozyme  46.38 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00527525  hitchhiker  0.00000000000000685681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  34.51 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  36.5 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 
196 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  29.8 
 
 
571 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  31.91 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  36.43 
 
 
165 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  35.33 
 
 
243 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  32.32 
 
 
165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1312  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.61 
 
 
307 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2036  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  53.57 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00134348  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 
177 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1740  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 
638 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.696561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 
165 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
178 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  29.94 
 
 
177 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  29.94 
 
 
177 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>