65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4051 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4051  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
267 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  30.73 
 
 
583 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  30.26 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  30.26 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  30.19 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  34.36 
 
 
225 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  34.36 
 
 
225 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  27.39 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1679  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.98 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101055  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  30.52 
 
 
153 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  29.33 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  29.33 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  28.39 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  32.7 
 
 
205 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  31.17 
 
 
143 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  30.19 
 
 
149 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  30.19 
 
 
149 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  21.74 
 
 
243 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  29.56 
 
 
149 aa  58.9  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  26.42 
 
 
143 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  28.48 
 
 
165 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  30.51 
 
 
571 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 
186 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 
417 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  24.68 
 
 
391 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  28.76 
 
 
166 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  28.57 
 
 
165 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4178  phage related lysozyme  35 
 
 
96 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.579424  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 
341 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  28.1 
 
 
166 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0625  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like  26.22 
 
 
209 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  26.75 
 
 
186 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 
554 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  30.69 
 
 
166 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  30.69 
 
 
166 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  25 
 
 
167 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
182 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  37.7 
 
 
423 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  27.22 
 
 
164 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  26.98 
 
 
175 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0578  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.89 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  34.33 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  44 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 
974 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  28 
 
 
164 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  24.82 
 
 
165 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  25.53 
 
 
165 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2751  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.35 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  25.37 
 
 
163 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  35.38 
 
 
187 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  25.35 
 
 
165 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  25.53 
 
 
165 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.07 
 
 
629 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  27.52 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 
433 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  23.9 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  25.37 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.58 
 
 
422 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 
410 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  28.45 
 
 
158 aa  42.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  24.75 
 
 
165 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.67 
 
 
1012 aa  42  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.43 
 
 
274 aa  42  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>