136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1402 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  100 
 
 		 149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  100 
 
 		 149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  97.32 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  57.43 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  53.02 
 
 		 166 aa  143  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  55.03 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  53.38 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  50.34 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  54.36 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  54.73 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  54.05 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  53.06 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  52.38 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  53.06 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  50.68 
 
 		 205 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  51.02 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  51.35 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  49.69 
 
 		 225 aa  120  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  49.69 
 
 		 225 aa  120  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  44.9 
 
 		 220 aa  120  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  48.99 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  51.02 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  49.66 
 
 		 166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  49.66 
 
 		 166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  44.52 
 
 		 220 aa  115  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  49.34 
 
 		 341 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  52.38 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 186 aa  110  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  45 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  41.01 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  43.54 
 
 		 182 aa  100  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  47.06 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2335  Phage-related lysozyme  36.36 
 
 		 270 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  41.1 
 
 		 391 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  42.21 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  46.51 
 
 		 178 aa  91.3  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  40.74 
 
 		 165 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  42.86 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  40 
 
 		 165 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  40.54 
 
 		 243 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  35.14 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  38 
 
 		 178 aa  87.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  40 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  41.83 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 417 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 211 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  39.26 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  39.26 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  39.26 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  39.26 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  41.01 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  41.38 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  35.14 
 
 		 170 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  48.12 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  48.12 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  39.22 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  38.96 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 		 196 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  40.67 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  37.32 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  34 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  34.09 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  34.46 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  34.9 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  35.14 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  34.9 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  35.34 
 
 		 187 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  36.23 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  33.92 
 
 		 260 aa  73.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  33.09 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2036  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  65 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00134348  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  38 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  34.93 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  36.23 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  36.55 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  38.82 
 
 		 583 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  36 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  36 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  36 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0567  lysozyme  43.53 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00527525  hitchhiker  0.00000000000000685681 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  36.05 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  32.43 
 
 		 169 aa  67  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  34.21 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  36.67 
 
 		 177 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  36.67 
 
 		 177 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4178  phage related lysozyme  43 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.579424  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  35.86 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  35.17 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  35.33 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  36.49 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  35.33 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  36.55 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  34.67 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  31.08 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  36 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  34.48 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  34.51 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  35.33 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>