123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0912 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  95.12 
 
 		 164 aa  319  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  87.27 
 
 		 166 aa  289  9e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  84.24 
 
 		 166 aa  279  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  83.03 
 
 		 166 aa  277  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  83.03 
 
 		 166 aa  277  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  89.93 
 
 		 165 aa  276  7e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  51.05 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  46.85 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  52.38 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  52.38 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  48.98 
 
 		 205 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  51.7 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  51.37 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  49.65 
 
 		 166 aa  123  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  47.52 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  50.68 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  50.7 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  50 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  46.9 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  48.57 
 
 		 225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  48.57 
 
 		 225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  44.12 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  46.9 
 
 		 341 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  44.9 
 
 		 220 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  50 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  40.25 
 
 		 220 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  44.7 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  43.75 
 
 		 145 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  45.11 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  45.11 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  39.53 
 
 		 167 aa  90.5  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  41.35 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  38.93 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  41.3 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  38.93 
 
 		 165 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  40 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  35.46 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  37.66 
 
 		 156 aa  84.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  38.76 
 
 		 165 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  37.78 
 
 		 159 aa  84.3  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  38.41 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  39.26 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  39.26 
 
 		 170 aa  84  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  35.95 
 
 		 182 aa  84  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  39.26 
 
 		 171 aa  84  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  37.4 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  40.15 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  37.4 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  37.4 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  37.4 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  46.22 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  38.93 
 
 		 417 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  45.38 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  40.25 
 
 		 391 aa  80.9  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  34.42 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  39.37 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  36.17 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  39.26 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  34.42 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  35.92 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  40.88 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  39.26 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  33.97 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2335  Phage-related lysozyme  40.85 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  40.97 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  39.68 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  36.13 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  37.06 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  37.14 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  35.77 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  32.48 
 
 		 583 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  36.36 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  37.78 
 
 		 155 aa  72  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1312  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.59 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  34.69 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  34.94 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  44.54 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  36.84 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  35 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  43.94 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  35 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  35 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  34.29 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1046  lysozyme  31.97 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  34.75 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  34.29 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 571 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  35 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  33.57 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  33.57 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  33.57 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  32.84 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0567  lysozyme  46.27 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00527525  hitchhiker  0.00000000000000685681 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  32.86 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  33.57 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  33.57 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>