112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2612 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  40.41 
 
 
220 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  47.58 
 
 
178 aa  101  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  43.54 
 
 
149 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  43.54 
 
 
149 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  43.54 
 
 
149 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  42.86 
 
 
142 aa  99.4  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  40.82 
 
 
148 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  39.24 
 
 
152 aa  92.8  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  39.19 
 
 
153 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  39.74 
 
 
154 aa  92  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  40.26 
 
 
156 aa  91.3  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  39.44 
 
 
143 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  43.22 
 
 
220 aa  90.5  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  38.12 
 
 
153 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  38.56 
 
 
165 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  38.57 
 
 
150 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  40 
 
 
148 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  36.91 
 
 
157 aa  85.9  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  37.91 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  39.29 
 
 
148 aa  85.1  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  36.48 
 
 
153 aa  84.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  35.95 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  37.04 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  37.14 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  37.14 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  36.3 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  36.88 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  47.31 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  47.31 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  35.29 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  40.71 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  35.9 
 
 
391 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  40.94 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  35.56 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  35.56 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  34.27 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  35.56 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  34.64 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  34.81 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  35.56 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  35.61 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  32.68 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  32.68 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  33.97 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  35.17 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  32.48 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  32.89 
 
 
417 aa  62  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  38.14 
 
 
187 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  32.81 
 
 
583 aa  61.2  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  32.54 
 
 
177 aa  60.8  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  35.07 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  33.86 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  33.81 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  33.07 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 
159 aa  58.5  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  38.14 
 
 
187 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 
571 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  30.72 
 
 
154 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  28.03 
 
 
178 aa  55.1  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  28.03 
 
 
177 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  28.03 
 
 
177 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  28.03 
 
 
177 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  28.03 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  28.03 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  28.03 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2036  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  51.85 
 
 
95 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00134348  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  27.39 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  27.39 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  27.39 
 
 
177 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  32.71 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  32.71 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 
260 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  32.38 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  32.38 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 
155 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  32.38 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0912  phage lysozyme  35.83 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  32.38 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  27.39 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  29.41 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  28.68 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  28.68 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  42.59 
 
 
136 aa  48.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.86 
 
 
414 aa  48.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4051  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25 
 
 
267 aa  47.8  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  30.5 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  30.99 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  32.03 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  28.85 
 
 
174 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  30.37 
 
 
169 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  31.3 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  36.08 
 
 
209 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0567  lysozyme  38.81 
 
 
92 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00527525  hitchhiker  0.00000000000000685681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  29.41 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>