66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0567 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0567  lysozyme  100 
 
 		 92 aa  191  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00527525  hitchhiker  0.00000000000000685681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  50.72 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  50.72 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  43.53 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  43.53 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  48.53 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  45.57 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  48.53 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  47.83 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  42.35 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  46.38 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  47.83 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  47.06 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  40.58 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  46.27 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  46.27 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  46.27 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  46.27 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  46.27 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  44.93 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  42.03 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  44.78 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  44.78 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  38.81 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  42.86 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  41.1 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  49.18 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  49.18 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  44.12 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  47.54 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  47.54 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  47.54 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  39.13 
 
 		 220 aa  53.5  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  44.59 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  37.68 
 
 		 220 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  35.23 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  47.76 
 
 		 341 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  44.93 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  41.1 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  40.91 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  40.91 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  36.76 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 260 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2335  Phage-related lysozyme  37.21 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  39.71 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  42.03 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  37.31 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  40.58 
 
 		 205 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  36.9 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  38.24 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  42.03 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  35.29 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  35.16 
 
 		 391 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  44.64 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  38.81 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  35.37 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 		 417 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  30.77 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  41.38 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 		 187 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  32.39 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 		 170 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>