128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5063 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  100 
 
 
153 aa  297  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  100 
 
 
153 aa  297  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  61.94 
 
 
157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  55.15 
 
 
158 aa  147  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  46.05 
 
 
165 aa  136  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  48.46 
 
 
165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  45.45 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  48.46 
 
 
163 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  48.46 
 
 
165 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  48.46 
 
 
165 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  50.33 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  49.23 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  48.46 
 
 
165 aa  124  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  44.08 
 
 
167 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  43.51 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  50 
 
 
220 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 
136 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  45.04 
 
 
143 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 
165 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  44.9 
 
 
154 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  44.51 
 
 
165 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  43.18 
 
 
220 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  41.29 
 
 
155 aa  100  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  43.59 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  44.76 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  38.36 
 
 
179 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  37.11 
 
 
179 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  40.13 
 
 
159 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  41.54 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  46.62 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  42.96 
 
 
205 aa  96.3  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  46.62 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  43.61 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  44.93 
 
 
164 aa  94.4  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  43.61 
 
 
150 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  45.07 
 
 
166 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  44.29 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  43.85 
 
 
143 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  44.37 
 
 
166 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  35.8 
 
 
178 aa  90.5  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  44.93 
 
 
165 aa  90.5  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  41.35 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  43.45 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  43.45 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  36.36 
 
 
178 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  35.22 
 
 
177 aa  87.8  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  36.26 
 
 
185 aa  87  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 
225 aa  87  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 
225 aa  87  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  47.1 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  47.1 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  46.38 
 
 
149 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  38.73 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  40.85 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  36 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  35.15 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  37.4 
 
 
186 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  37.24 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  32.7 
 
 
177 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  47.31 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  32.7 
 
 
177 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  32.7 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  32.7 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  33.77 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  32.7 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  32.7 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  40 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  38.6 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  38.6 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  53.85 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  32.7 
 
 
177 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  35.46 
 
 
177 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  32.08 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  39.84 
 
 
211 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  32.08 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  32.08 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  34.09 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  38.36 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  40.14 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  39.57 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  40.29 
 
 
154 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  37.67 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  32 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  38.17 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  31.17 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  36.59 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  41.13 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  46.48 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  36.92 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2350  phage related lysozyme protein  34.81 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  36.13 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  35.09 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  39.33 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  34.5 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  36.64 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>