120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2404 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  100 
 
 		 154 aa  317  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  46.75 
 
 		 196 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  47.22 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  41.67 
 
 		 179 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  41.38 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  41.38 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  42.95 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  38.97 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  40.69 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  45.74 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  45.74 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  38.69 
 
 		 169 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  35.17 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  40 
 
 		 220 aa  87.8  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  39.62 
 
 		 184 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  39.84 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  36.03 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  35.56 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  33.11 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2350  phage related lysozyme protein  36.18 
 
 		 192 aa  84  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  36.09 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  38.94 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  34.44 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  34.67 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  35.88 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  35.88 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  35.88 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  36.03 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  35.88 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  37.42 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  34.19 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  34.59 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  33.55 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  34.07 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  37.67 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  34.07 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  35.71 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3556  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  34.73 
 
 		 401 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.647883  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  32.85 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  33.97 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 		 165 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  34.29 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 341 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  34.31 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  32.65 
 
 		 205 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 		 417 aa  67  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  37.04 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  37.68 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  32.48 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  32.48 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  34.81 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  34.81 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  34.07 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  31.72 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  34.31 
 
 		 211 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  32.93 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  34.81 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  30.72 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  30.43 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  30.43 
 
 		 178 aa  57  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  32.41 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  33.58 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0567  lysozyme  41.1 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00527525  hitchhiker  0.00000000000000685681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  32.28 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  32.59 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  32.61 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  30.53 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  30.53 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  30.23 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  29.37 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  30.28 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  30.56 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  29.33 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  29.56 
 
 		 391 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  26.09 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  29.33 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  29.33 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  30.99 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1046  lysozyme  29.14 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  30.99 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  29.77 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  30.28 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  29.77 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 243 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  30.83 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  28 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  29.01 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  29.77 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  29.77 
 
 		 177 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  29.77 
 
 		 177 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  30.77 
 
 		 209 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>