125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3256 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 159 aa  329  9e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  63.87 
 
 		 155 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  52.23 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  52.05 
 
 		 177 aa  157  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  52.05 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  52.05 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  50.88 
 
 		 174 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  44.23 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  41.38 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  41.38 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  39.08 
 
 		 185 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  40.82 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  39.51 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  42.54 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  42.54 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  43.08 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  41.79 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  38.71 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  42.54 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  38.56 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  37.82 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  42.54 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  40.56 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  36.31 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  41.09 
 
 		 165 aa  90.5  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  36.03 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  40.48 
 
 		 153 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  40.48 
 
 		 153 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  37.96 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  39.26 
 
 		 341 aa  84.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  35.56 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  32.86 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  38.52 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  36.57 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  34.78 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  36.13 
 
 		 391 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  35.97 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  37.04 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  35.97 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  36.23 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  36.23 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  32.56 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  36.23 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  33.33 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  35 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  34.56 
 
 		 170 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  34.87 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  36.11 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  33.57 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  36.97 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  34.23 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  32.14 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  32.9 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  36.5 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  36.5 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  36.44 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  33.58 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  32.84 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  33.61 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  33.61 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  33.93 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  31.13 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  32.9 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  32.9 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  32.9 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  30.53 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  31.62 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  32.84 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  32.12 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  33.05 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  32.09 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  31.34 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  33.05 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  30.13 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  33.05 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  30.77 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  30.77 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  30.77 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  33.05 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  29.7 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  32.12 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  31.39 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  32.12 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0196212 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  31.39 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  30.77 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  31.39 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  31.34 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  31.34 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2903  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  29.68 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188915  normal  0.371774 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  32.2 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4670  glycoside hydrolase family protein  30.15 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  0.812257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>