125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01975 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  334  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  55.28 
 
 		 165 aa  190  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  57.62 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  59.29 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  60 
 
 		 165 aa  185  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  59.29 
 
 		 165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  58.57 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  58.57 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  57.86 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  47.97 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  47.3 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  38.93 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  46.09 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  46.09 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  40.82 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  42.64 
 
 		 136 aa  104  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  37.88 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  39.1 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  37.31 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  33.99 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  39.39 
 
 		 220 aa  95.9  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  39.85 
 
 		 169 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  37.96 
 
 		 150 aa  94  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  37.59 
 
 		 170 aa  93.6  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  37.96 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  36.2 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  37.23 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  37.23 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  35.77 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  34.85 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  39.26 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  38.52 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  38.93 
 
 		 178 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  34.97 
 
 		 174 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  34.81 
 
 		 225 aa  87.4  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  34.81 
 
 		 225 aa  87.4  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  34.85 
 
 		 220 aa  87  8e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  34.36 
 
 		 174 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  39.39 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  39.39 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  37.88 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  39.39 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  34.81 
 
 		 205 aa  84.3  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  37.78 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  34.59 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  31.25 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  34.56 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  37.04 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  38.52 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  37.04 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  37.04 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  34.64 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  35.33 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  35.17 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 		 341 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  31.07 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  34.27 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  32.3 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  31.68 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 188 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  32.92 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  32.92 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  33.09 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  29.56 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  33.09 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  32.3 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  34.93 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  35.16 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  37.4 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  31.68 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  31.68 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  31.68 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  34.69 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  31.68 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  32.3 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  28.93 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  32.59 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4670  glycoside hydrolase family protein  31.54 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  0.812257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  31.68 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  31.65 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  31.68 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  31.68 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  31.06 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  29.75 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  31.06 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  29.7 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  29.7 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  31.06 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  30.43 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  27.39 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  30.08 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  33.11 
 
 		 391 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  30.34 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  35.54 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  31.06 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  29.45 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>