119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4180 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
414 aa  847    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  60 
 
 
225 aa  64.7  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  60 
 
 
225 aa  64.7  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2036  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  58.06 
 
 
95 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00134348  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4086  hypothetical protein  27.32 
 
 
248 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4049  hypothetical protein  27.32 
 
 
248 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.46 
 
 
531 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  55.17 
 
 
142 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.3 
 
 
433 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.18 
 
 
321 aa  56.6  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  55.93 
 
 
158 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  49.18 
 
 
205 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  50.88 
 
 
341 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  50.85 
 
 
155 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  49.15 
 
 
164 aa  53.9  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  50 
 
 
150 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  49.15 
 
 
164 aa  53.5  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  49.15 
 
 
166 aa  53.5  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  49.15 
 
 
166 aa  53.5  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  49.15 
 
 
166 aa  53.1  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  49.15 
 
 
166 aa  53.1  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  50 
 
 
150 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  50.85 
 
 
157 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  44.44 
 
 
153 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.1 
 
 
283 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  55.36 
 
 
153 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  55.36 
 
 
153 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  42.62 
 
 
154 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  51.67 
 
 
149 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  51.67 
 
 
149 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  42.62 
 
 
148 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  42.65 
 
 
165 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  49.15 
 
 
165 aa  51.6  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  48.28 
 
 
149 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  46.55 
 
 
163 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  48.33 
 
 
143 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  46.55 
 
 
165 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  49.15 
 
 
220 aa  50.4  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  46.55 
 
 
165 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  54.24 
 
 
163 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  46.55 
 
 
165 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  46.55 
 
 
165 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2335  Phage-related lysozyme  52.83 
 
 
270 aa  49.7  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  39.02 
 
 
264 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  46.55 
 
 
165 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  45.76 
 
 
165 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  44.07 
 
 
159 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  40 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  47.37 
 
 
175 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  43.75 
 
 
228 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  42.62 
 
 
270 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  47.37 
 
 
153 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  43.86 
 
 
153 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.86 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  45.45 
 
 
247 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  42.86 
 
 
383 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  47.46 
 
 
186 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  32.58 
 
 
220 aa  47.8  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  44.07 
 
 
165 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  44.26 
 
 
143 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  43.86 
 
 
182 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.79 
 
 
266 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.48 
 
 
249 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.62 
 
 
270 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  45.61 
 
 
156 aa  47.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.38 
 
 
294 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  51.06 
 
 
229 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  42.11 
 
 
152 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  38.57 
 
 
259 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.57 
 
 
305 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4085  hypothetical protein  28.29 
 
 
183 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  44.83 
 
 
167 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  38.57 
 
 
259 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4048  hypothetical protein  28.29 
 
 
183 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  50 
 
 
267 aa  46.6  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  45.45 
 
 
234 aa  46.6  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  43.64 
 
 
253 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  44.12 
 
 
358 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1729  putative endolysin (lysis protein) (lysozyme)  46.94 
 
 
169 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171325  normal  0.0114013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.79 
 
 
315 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  52.17 
 
 
178 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  45.65 
 
 
406 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4670  glycoside hydrolase family protein  37.7 
 
 
203 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  0.812257 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.64 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  43.64 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.67 
 
 
508 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.64 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.13 
 
 
243 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.55 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  33.7 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  42.59 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  38.24 
 
 
259 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  46.03 
 
 
236 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.16 
 
 
1089 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.64 
 
 
259 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.64 
 
 
253 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.64 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.75 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.77 
 
 
580 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  41.67 
 
 
170 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>