93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1270 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  100 
 
 
177 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  96.05 
 
 
177 aa  351  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  94.35 
 
 
177 aa  349  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  94.35 
 
 
177 aa  346  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  94.35 
 
 
177 aa  346  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  92.66 
 
 
177 aa  343  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  92.66 
 
 
177 aa  342  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  90.96 
 
 
177 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  90.96 
 
 
177 aa  342  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  90.96 
 
 
177 aa  340  4e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  92.09 
 
 
177 aa  340  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  92.09 
 
 
177 aa  340  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  90.96 
 
 
177 aa  339  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  89.27 
 
 
177 aa  335  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  90.96 
 
 
177 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  89.27 
 
 
177 aa  333  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  88.7 
 
 
177 aa  332  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  88.7 
 
 
177 aa  332  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  70.86 
 
 
179 aa  276  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  68.36 
 
 
179 aa  271  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  68.02 
 
 
178 aa  258  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  68.6 
 
 
178 aa  256  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3876  lysozyme  87.67 
 
 
76 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2236  hypothetical protein  64.29 
 
 
137 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  36 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  32.95 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  36.03 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  36.03 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  31.64 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  32.88 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  32.88 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  32.19 
 
 
165 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  32.41 
 
 
220 aa  72  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  32.88 
 
 
165 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  32.88 
 
 
165 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  32.88 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  36.84 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  31.43 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 
211 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  30.43 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  34.59 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  29.93 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  35.33 
 
 
149 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  35.33 
 
 
149 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  34.27 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  31.17 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  34.48 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  33.06 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  28.93 
 
 
153 aa  57.8  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  32.74 
 
 
187 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  32.87 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  32.86 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  33.79 
 
 
145 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  32.17 
 
 
188 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 
163 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  30.34 
 
 
150 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  34.4 
 
 
136 aa  54.3  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  30.34 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  32.72 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  34.75 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  33.63 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  34.75 
 
 
166 aa  52  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  32.3 
 
 
163 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  35.59 
 
 
166 aa  51.2  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  36.84 
 
 
166 aa  50.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  34.58 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  34.58 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  28.93 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  31.03 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  28.16 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  28.93 
 
 
148 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  32.86 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  37.8 
 
 
225 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  37.8 
 
 
225 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  28.75 
 
 
154 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  32 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 
186 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  28.75 
 
 
153 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 
341 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  29.44 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  32.11 
 
 
175 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 
165 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  32.19 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  29.13 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  29.33 
 
 
198 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  26.32 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  26.74 
 
 
143 aa  41.2  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 
168 aa  40.8  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>