62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2036 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2036  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  100 
 
 
95 aa  186  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00134348  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  65 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  65 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  63.33 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  53.33 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  63.46 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  63.46 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.06 
 
 
414 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  55.36 
 
 
205 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  58.93 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  53.33 
 
 
225 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  58.93 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  53.33 
 
 
225 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2335  Phage-related lysozyme  57.69 
 
 
270 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  52.54 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  50 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  50 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  50 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  50 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  46.38 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  55.36 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  48.28 
 
 
166 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  48.28 
 
 
166 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  53.7 
 
 
175 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  46.55 
 
 
220 aa  53.9  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  50 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  51.85 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  53.57 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  53.57 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  44.07 
 
 
220 aa  51.6  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  42.42 
 
 
178 aa  51.6  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  44.44 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  44.44 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  44.44 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  44.44 
 
 
165 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  44.44 
 
 
165 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  44.44 
 
 
165 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  50 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  44.44 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  39.29 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  43.48 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  42.59 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  36.17 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  44.12 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  43.64 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  43.28 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 
260 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  45.76 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  37.5 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  48 
 
 
156 aa  42.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  42.19 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  44.44 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  44.44 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  32.1 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  37.88 
 
 
170 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  41.38 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  41.94 
 
 
341 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  40.35 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 
165 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>