119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1305 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  45.19 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  48.48 
 
 		 179 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  46.97 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  46.97 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  42.64 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  44.52 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  41.98 
 
 		 165 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  41.98 
 
 		 163 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  42.75 
 
 		 165 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  41.98 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  41.98 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  41.22 
 
 		 165 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  41.22 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  42.42 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  41.98 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  37.41 
 
 		 220 aa  87  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  38.73 
 
 		 165 aa  87  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 196 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  37.21 
 
 		 220 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  37.32 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  38.81 
 
 		 169 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2350  phage related lysozyme protein  39.86 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  37.21 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  36.62 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  36.57 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  37.75 
 
 		 198 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  34.78 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  37.31 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  34.07 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  32.06 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  36.03 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  35.07 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  35.07 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  33.33 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  34.51 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  31.39 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  32.84 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  33.08 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  32.84 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  33.07 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  31.3 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0449  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  31.3 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  29.61 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  34.4 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 		 177 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  30.94 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3556  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  31.72 
 
 		 401 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.647883  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4670  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  0.812257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  32.86 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  32.86 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  32.86 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  36.51 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  35.2 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  35.2 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  29.87 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  29.93 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  34.4 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  32.81 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  32.81 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  26.43 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  34.4 
 
 		 177 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  33.6 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  33.6 
 
 		 177 aa  52  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  33.6 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  34.4 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  30.5 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  33.6 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  33.6 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  30.6 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  34.4 
 
 		 177 aa  50.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  32.8 
 
 		 177 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  32.8 
 
 		 177 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3826  glycoside hydrolase family 24  29.17 
 
 		 181 aa  50.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  32.8 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  32.8 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  33.33 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  34.83 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  29.77 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  29.77 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  29.08 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  29.08 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  32.11 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  42.59 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>