51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3077 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  100 
 
 		 177 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  32.95 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  32.56 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  30.81 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  34.81 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  36.73 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  36.73 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  32.24 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  33.51 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 136 aa  62  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2350  phage related lysozyme protein  31.72 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  31.08 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  33.97 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  31.16 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  30.41 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  28.82 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  30.41 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  29.05 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  29.73 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  32.76 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  29.73 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  30.41 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  31.17 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  29.79 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  31.4 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  38.04 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  31.21 
 
 		 220 aa  52.4  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0449  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  31.58 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3556  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  30.23 
 
 		 401 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.647883  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  35.96 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  33.04 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  32.61 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 		 171 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  30.97 
 
 		 170 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  29.51 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  30.97 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  28.99 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  29.38 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  29.83 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  28.22 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  28.96 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  31.25 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  31.15 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  28.42 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  33.33 
 
 		 178 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  34.06 
 
 		 178 aa  40.8  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>