39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3556 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3556  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  100 
 
 		 401 aa  778    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.647883  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  33.76 
 
 		 163 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  34.69 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  36.62 
 
 		 154 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  32.65 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  34.9 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  33.33 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  32 
 
 		 220 aa  57  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 170 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  31.72 
 
 		 136 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  30.61 
 
 		 220 aa  54.3  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  29.79 
 
 		 163 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  30.4 
 
 		 165 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  30.4 
 
 		 165 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  29.6 
 
 		 165 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  34.04 
 
 		 153 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  34.04 
 
 		 153 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2350  phage related lysozyme protein  31.45 
 
 		 192 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  29.6 
 
 		 163 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  29.6 
 
 		 165 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  29.6 
 
 		 165 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  42.42 
 
 		 169 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  42.42 
 
 		 170 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  42.42 
 
 		 170 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  42.42 
 
 		 171 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  31.01 
 
 		 177 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  29.6 
 
 		 165 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  38.03 
 
 		 170 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 155 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 159 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  31.98 
 
 		 158 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 196 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  28.06 
 
 		 167 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0449  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 157 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  39.39 
 
 		 169 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4670  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 203 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  0.812257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  29.77 
 
 		 159 aa  43.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  26.9 
 
 		 143 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>