34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4670 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4670  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  0.812257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1729  putative endolysin (lysis protein) (lysozyme)  56.25 
 
 		 169 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171325  normal  0.0114013 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  31.54 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  28.04 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  27.75 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  23.94 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  28.28 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  38.71 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  28.36 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  28.99 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  32.81 
 
 		 153 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  32.81 
 
 		 153 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  23.94 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  28.36 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  28.36 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  28.36 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  23.4 
 
 		 177 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 		 168 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  36.72 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  22.58 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  40.32 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 414 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  39.06 
 
 		 341 aa  45.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  31.45 
 
 		 158 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3556  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  29.63 
 
 		 401 aa  45.1  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.647883  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  40.96 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  23.46 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  41.18 
 
 		 205 aa  42  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  30.08 
 
 		 175 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>