69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3605 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
177 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  95.48 
 
 
177 aa  349  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  94.25 
 
 
174 aa  339  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  93.68 
 
 
174 aa  336  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  48.91 
 
 
188 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  48.62 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  52.05 
 
 
159 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  49.71 
 
 
163 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  47.37 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  40.12 
 
 
157 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  36.2 
 
 
159 aa  92.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  32.74 
 
 
165 aa  91.3  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  32.14 
 
 
167 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  36.15 
 
 
163 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  36.15 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  36.15 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  36.15 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  35.38 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  36.15 
 
 
165 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  32.35 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  33.59 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  33.09 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  33.82 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  33.82 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  33.59 
 
 
341 aa  61.6  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  30.08 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  33.09 
 
 
150 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  33.09 
 
 
150 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  32.85 
 
 
196 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  29.14 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  28.65 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 
136 aa  55.1  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4670  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 
203 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  0.812257 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  30.99 
 
 
205 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  31.58 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  29.09 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  29.77 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  29.51 
 
 
225 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  29.51 
 
 
225 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  30.66 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  30.66 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  33.09 
 
 
148 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1729  putative endolysin (lysis protein) (lysozyme)  25.31 
 
 
169 aa  47.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171325  normal  0.0114013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3296  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  24.63 
 
 
170 aa  47.8  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938297  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  31.01 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  28.86 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  26.71 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  27.69 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 
171 aa  44.3  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  28.57 
 
 
169 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  22.37 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  28.1 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  32.93 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 
414 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1312  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.3 
 
 
307 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  28.1 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 
154 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  32.12 
 
 
177 aa  41.6  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  35.71 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  32.12 
 
 
177 aa  41.6  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  35.71 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  31.16 
 
 
156 aa  41.2  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
170 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>