78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2642 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  46.75 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  41.56 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  38.1 
 
 		 158 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 136 aa  86.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  36.05 
 
 		 157 aa  85.5  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  36.99 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  32.09 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  34.53 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  34.53 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  35.81 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  36.04 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  35.46 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  34.44 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  38.35 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  38.35 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  34.19 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  34.48 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  34.48 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  33.09 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  36.36 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  34.48 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  35.48 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  34.48 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  34.48 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  33.79 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  34.46 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  35.37 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 		 155 aa  72  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  31.21 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  31.25 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  30.37 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  31.62 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  30.15 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  33.09 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  33.09 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2350  phage related lysozyme protein  30.32 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  28.24 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  32.85 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  32.17 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  32.17 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  32.85 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  28.68 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  28.68 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  31.29 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  31.39 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  28.68 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  31.67 
 
 		 175 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  27.66 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  29.29 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  30.47 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  27.86 
 
 		 417 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  30.72 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  28.99 
 
 		 150 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2335  Phage-related lysozyme  28.04 
 
 		 270 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  28.99 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  31.16 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  27.78 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  29.71 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  29.41 
 
 		 164 aa  45.1  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  27.35 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  29.63 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  28.21 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  28.89 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  29.63 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3556  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  28.87 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.647883  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  30.93 
 
 		 182 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  30.68 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>