36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1729 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1729  putative endolysin (lysis protein) (lysozyme)  100 
 
 		 169 aa  351  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171325  normal  0.0114013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4670  glycoside hydrolase family protein  56.25 
 
 		 203 aa  171  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  0.812257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  33.55 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  27.66 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  29.1 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  29.1 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  30.28 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  29.1 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  25.93 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  30.28 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 177 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  30.56 
 
 		 165 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  25.42 
 
 		 188 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  27.69 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  30.28 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.94 
 
 		 414 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  31.09 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  31.45 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  30.91 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  30.91 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 		 341 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  30.08 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  25.52 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  23.73 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  34.92 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  34.19 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  34.19 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  35.8 
 
 		 153 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  31.71 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  35.8 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  24.07 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  40.98 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>