100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0883 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  100 
 
 		 153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  96.08 
 
 		 153 aa  298  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  80 
 
 		 154 aa  257  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  76.32 
 
 		 156 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  80.42 
 
 		 148 aa  246  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  77.33 
 
 		 152 aa  245  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  39.07 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  37.33 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  42.21 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  42.21 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  39.04 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  38.12 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  38.57 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  42.21 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  34.19 
 
 		 220 aa  89.4  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  38.36 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  37.76 
 
 		 157 aa  84  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  43.24 
 
 		 148 aa  84  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  35 
 
 		 178 aa  83.6  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  43.24 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  39.2 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  39.83 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  37.78 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  39.83 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  35.71 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  39.83 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  37.86 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  34.42 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  34 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  34.42 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  38.98 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  37.16 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  35.95 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  38.98 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  38.98 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  37.66 
 
 		 341 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  38.14 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  33.77 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  42.24 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  33.12 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  38.13 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  38.13 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  33.12 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  38.13 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  33.12 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  33.76 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  32.75 
 
 		 260 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  38.13 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  38.13 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  33.54 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  33.54 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  34.93 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  32.84 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  35.34 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  32.88 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  34.33 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  33.74 
 
 		 391 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  33.61 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  28.3 
 
 		 186 aa  60.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  32.9 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  35.43 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  34.02 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  32.77 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  35.58 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  33.65 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  34.51 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  32.81 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3826  glycoside hydrolase family 24  29.66 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1046  lysozyme  26.71 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  29.13 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  40.96 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  30.22 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.37 
 
 		 414 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0912  phage lysozyme  28.93 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1015  lysozyme  28.93 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  29.49 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 		 243 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  29.13 
 
 		 177 aa  44.3  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  29.13 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2036  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  44.44 
 
 		 95 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00134348  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  26.85 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  31.13 
 
 		 583 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 174 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  25.52 
 
 		 165 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1729  putative endolysin (lysis protein) (lysozyme)  35.8 
 
 		 169 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171325  normal  0.0114013 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2335  Phage-related lysozyme  29.05 
 
 		 270 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  28.4 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  28.35 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  27.86 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  29.13 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  29.13 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  29.13 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>