114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3421 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  87.07 
 
 
154 aa  266  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  85.31 
 
 
152 aa  255  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  83.92 
 
 
156 aa  254  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  80.42 
 
 
153 aa  246  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  79.72 
 
 
153 aa  244  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  40.82 
 
 
182 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  34.48 
 
 
220 aa  90.1  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  36.91 
 
 
153 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  38.24 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  36.23 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  36.23 
 
 
150 aa  84.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  37.84 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  41.27 
 
 
167 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  40.65 
 
 
165 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  40.14 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  40.65 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  32.88 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  39.46 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  39.46 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  31.82 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  35.17 
 
 
220 aa  80.9  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  39.02 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  39.72 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  38.98 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  39.02 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  38.98 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  37.16 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  35.33 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  40.67 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  40.67 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  38.14 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  39.73 
 
 
341 aa  77.4  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  40.91 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  40.91 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  40.67 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  34.9 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  41.82 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  35.92 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  36.36 
 
 
164 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  36.36 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  34.56 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  36.36 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  34.81 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  39.32 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  39.32 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6523  glycoside hydrolase family protein  33.14 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.532315  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  35.51 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  35.66 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  35.66 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  36.88 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  34.25 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  34.04 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  32.89 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  31.72 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  32.89 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  32.89 
 
 
170 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  36.96 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02719  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  34.13 
 
 
391 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  36.97 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 
417 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3826  glycoside hydrolase family 24  30.14 
 
 
181 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  32.19 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  42.5 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  34.78 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  31.2 
 
 
177 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0912  phage lysozyme  32.77 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  31.2 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  32.5 
 
 
166 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  33.82 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  33.58 
 
 
165 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1015  lysozyme  32.77 
 
 
146 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.62 
 
 
414 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 
174 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  42.5 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  30.19 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  29.71 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4051  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28 
 
 
267 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  34.83 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  27.21 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  33.09 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  32 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  29.36 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2036  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  44.12 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00134348  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  32.56 
 
 
583 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1046  lysozyme  25.87 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  32.08 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  31.2 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  32.08 
 
 
178 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  31.2 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  32 
 
 
177 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  32 
 
 
177 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  32 
 
 
177 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  30.4 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  32 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>