90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2090 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  100 
 
 		 177 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  100 
 
 		 177 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  93.22 
 
 		 177 aa  345  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  93.22 
 
 		 177 aa  343  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  93.22 
 
 		 177 aa  343  8.999999999999999e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  92.66 
 
 		 177 aa  343  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  92.66 
 
 		 177 aa  343  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  90.4 
 
 		 177 aa  338  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  90.4 
 
 		 177 aa  338  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  89.83 
 
 		 177 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  89.83 
 
 		 177 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  89.83 
 
 		 177 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  89.83 
 
 		 177 aa  335  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  89.27 
 
 		 177 aa  334  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  89.27 
 
 		 177 aa  333  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  88.7 
 
 		 177 aa  332  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  88.14 
 
 		 177 aa  329  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  85.88 
 
 		 177 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  71.43 
 
 		 179 aa  278  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  70.06 
 
 		 179 aa  276  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  68 
 
 		 178 aa  259  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  68.57 
 
 		 178 aa  259  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3876  lysozyme  87.67 
 
 		 76 aa  132  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2236  hypothetical protein  62.96 
 
 		 137 aa  104  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  34.97 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  39.84 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  32.61 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  36.84 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  36.84 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  33.33 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  33.33 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  33.33 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  33.33 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  32.65 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  33.79 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  31.82 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  35.67 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  31.06 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  36.84 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  39.47 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  30.66 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  35.04 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  35.21 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  36.84 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  35.42 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  36.11 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  34.67 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  37.24 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  37.24 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  34.67 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  34.27 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  28.69 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  34.48 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  33.57 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  29.71 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  34.51 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  28.69 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  35 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  31.39 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  39.66 
 
 		 209 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  36.45 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  33.86 
 
 		 145 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  27.67 
 
 		 153 aa  50.8  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  31.94 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  40.24 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  40.24 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  34.51 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  29.13 
 
 		 142 aa  48.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 		 136 aa  47.8  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  29.3 
 
 		 148 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  29.3 
 
 		 148 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  30.17 
 
 		 154 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  30.38 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  31.79 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  31.5 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 		 341 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  26.14 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  31.01 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  32.88 
 
 		 165 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  32.17 
 
 		 174 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  28.95 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>