28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2236 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2236  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  64.37 
 
 		 177 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  64.37 
 
 		 177 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  64.37 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  64.37 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  64.29 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  67.9 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  63.22 
 
 		 177 aa  114  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  63.22 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  65.48 
 
 		 177 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  65.48 
 
 		 177 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  66.67 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  63.22 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  63.22 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  64.29 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  64.29 
 
 		 177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  60.92 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  62.96 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  62.96 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  50 
 
 		 179 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  50 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  50 
 
 		 178 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  48.84 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3876  lysozyme  63.38 
 
 		 76 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  48.33 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  40 
 
 		 198 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  35.11 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 		 188 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>