92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1136 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1136  lysozyme  100 
 
 
179 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1150  lysozyme  96.09 
 
 
179 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.258572  hitchhiker  0.0000000000000138553 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0944  phage lysozyme  72.88 
 
 
177 aa  288  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.330694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1450  phage lysozyme  71.19 
 
 
177 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3208  lysozyme  70.62 
 
 
177 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0196212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1858  lysozyme  70.62 
 
 
177 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3143  lysozyme  71.84 
 
 
177 aa  280  7.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.60318  hitchhiker  0.000000000619176 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1529  phage lysozyme  70.06 
 
 
177 aa  279  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01337  predicted lysozyme  70.06 
 
 
177 aa  278  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.343135  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01346  hypothetical protein  70.06 
 
 
177 aa  278  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1774  phage lysozyme  70.06 
 
 
177 aa  276  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.015497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2254  phage lysozyme  70.06 
 
 
177 aa  276  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000386881 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  70.06 
 
 
177 aa  276  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  70.06 
 
 
177 aa  276  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3526  lysozyme  70.11 
 
 
177 aa  274  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.68891  hitchhiker  0.0000339599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1183  phage lysozyme  70.52 
 
 
177 aa  274  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00117162  hitchhiker  0.0000000000363783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1644  phage lysozyme  68.36 
 
 
177 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2785  phage lysozyme  68.36 
 
 
177 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455094  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1270  phage lysozyme  68.36 
 
 
177 aa  271  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.209647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1174  lysozyme  68.36 
 
 
177 aa  271  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.847559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2248  lysozyme  70.35 
 
 
178 aa  259  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2609  lysozyme  68.6 
 
 
178 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.013223  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3876  lysozyme  58.9 
 
 
76 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2236  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  39.01 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  39.01 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  31.43 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  34.29 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  34.29 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  34.29 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  34.29 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  34.29 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  34.29 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 
157 aa  80.5  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  30.86 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  37.7 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  35.17 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  29.56 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  32.85 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  33.79 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5979  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 
211 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  33.79 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  34.84 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  33.79 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  33.59 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  33.1 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  35.4 
 
 
187 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  35 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  36.62 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  34.83 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  29.41 
 
 
143 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  34.51 
 
 
187 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  28.3 
 
 
153 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  37.96 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  31.93 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  33.65 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3192  putative lysozyme (endolysin) protein  33.65 
 
 
153 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.226496 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  31.75 
 
 
175 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  35.94 
 
 
188 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  38.81 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  34.51 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  36.05 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  35.94 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  32.64 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
136 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  37.8 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  30.19 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  41.67 
 
 
150 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  33.72 
 
 
166 aa  48.5  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  33.72 
 
 
166 aa  48.5  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  30.1 
 
 
143 aa  48.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 
341 aa  48.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  41.67 
 
 
150 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  35.37 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  35.37 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3187  glycoside hydrolase family 24  28.7 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  27.63 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  29.94 
 
 
165 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  29.84 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  29.61 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  30.77 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  34.29 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 
186 aa  41.2  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1743  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 
170 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>