50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2350 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2350  phage related lysozyme protein  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109482  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  48.7 
 
 		 168 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  46.5 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  39.86 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  35.37 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  32.24 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  30.07 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  31.45 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  30.6 
 
 		 143 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  34.9 
 
 		 153 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  34.9 
 
 		 153 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  31.72 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  28.92 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  30.97 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  31.43 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  29.77 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  31.25 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  31.25 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  31.07 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  29.17 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  29.17 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  29.37 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  30.56 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  30.56 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  31.85 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  31.11 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  31.11 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  30.56 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  30.56 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  30.56 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3556  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  31.45 
 
 		 401 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.647883  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  30.22 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  32.12 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  25.15 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  24.85 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  30.37 
 
 		 164 aa  48.5  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 171 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0449  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  31.85 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  24.85 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  29.86 
 
 		 167 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  31.11 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  26.09 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  30.37 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  30.5 
 
 		 169 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  29.32 
 
 		 143 aa  42  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  27.54 
 
 		 142 aa  41.2  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>