40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0449 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0449  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 157 aa  320  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0116911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  37.06 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0751  glycoside hydrolase family 24  30.14 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  35.26 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  33.54 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  32.89 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  34.59 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  33.54 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  32.17 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  31.69 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  29.01 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  30.49 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  31.85 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  31.85 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  32.34 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  31.85 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  31.85 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  29.32 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  31.11 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3556  Phage-related lysozyme (muraminidase)-like protein  29.94 
 
 		 401 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.647883  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2350  phage related lysozyme protein  27.67 
 
 		 192 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  32.35 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  31.62 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  30.66 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  28.15 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  30.95 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  26.59 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  31.34 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  28.91 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  29.1 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  28.75 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 		 159 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>