79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1445 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  37.28 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2903  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  35.96 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188915  normal  0.371774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3296  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  33.53 
 
 		 170 aa  85.1  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  39.42 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4113  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  35.58 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000019692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1743  glycoside hydrolase family protein  32.77 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  42.15 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  42.15 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  39.6 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  37.23 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  41.41 
 
 		 165 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  39.07 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  40.97 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  39.07 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  40.56 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  40.56 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  38.41 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  39.26 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  41.27 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1875  glycoside hydrolase family 24  35.03 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0471339  normal  0.356094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  32.45 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  34.42 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 		 196 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  34.53 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  33.93 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  37.69 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  37.69 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  37.69 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  35.66 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  34.53 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  30.33 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  34.53 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  29.14 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2973  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  29.69 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  33.81 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  43.04 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  36.22 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  33.86 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2603  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  29.37 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369412  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 		 417 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  27.15 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  28.57 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  26.25 
 
 		 159 aa  48.9  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  30.15 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  30.4 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  26.59 
 
 		 178 aa  47.8  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  29.41 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  31.17 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  30.6 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  30.99 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1046  lysozyme  33.33 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  41.38 
 
 		 571 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  27.08 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  33.33 
 
 		 391 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  28.57 
 
 		 150 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  29.33 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2640  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  28.89 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0502424  hitchhiker  0.00410144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2606  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  28.89 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00071357  unclonable  3.49737e-16 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  26.39 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  26.39 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  26.39 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  26.39 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3077  glycoside hydrolase family 24  33.33 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  26.97 
 
 		 583 aa  42.4  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2493  glycoside hydrolase family 24  34.35 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  36.05 
 
 		 174 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  25.69 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>