15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2603 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2603  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  100 
 
 		 170 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369412  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2973  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  87.57 
 
 		 170 aa  315  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3296  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  55.76 
 
 		 170 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2903  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  46.56 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188915  normal  0.371774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4113  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  44.04 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000019692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1743  glycoside hydrolase family protein  49.11 
 
 		 170 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2606  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  33.33 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00071357  unclonable  3.49737e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2640  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  33.33 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0502424  hitchhiker  0.00410144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2239  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00579986  hitchhiker  0.0000000319845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  29.37 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 159 aa  44.3  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  31.91 
 
 		 145 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  28.12 
 
 		 149 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>